Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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