Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NCF4Q15080 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms