Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
R3HDM1Q15032 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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