Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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