Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CAMK2BQ13554 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CAMK2BQ13554 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms