Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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