Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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