Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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IFT88Q13099 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
IFT88Q13099 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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