Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRDP23468 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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