Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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