Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
C17orf47Q8NEP4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms