Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL049833.2-201ENST00000557211 750 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 BCAP31P2-201ENST00000563143 399 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 BCAP31P1-201ENST00000565437 385 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF283-205ENST00000590950 466 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SMCO4P1-201ENST00000592909 177 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC010223.1-201ENST00000625092 279 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FAM240B-202ENST00000637691 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LYPLA2P3-201ENST00000417429 576 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC114737.1-201ENST00000434531 453 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC005522.2-201ENST00000479299 453 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNORA76.1-201ENST00000516313 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC109635.2-202ENST00000529219 500 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 FLT1-205ENST00000543394 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 CD63-206ENST00000548160 648 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR4682-201ENST00000580643 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL356458.1-201ENST00000604764 465 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ANKRD39Q53RE8 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms