Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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