Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Q1T7F1 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RN7SKP270-201ENST00000411297 312 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL138689.1-201ENST00000614612 668 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Q1T7F1 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Q1T7F1 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Q1T7F1 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Q1T7F1 NPC2-201ENST00000238633 796 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Q1T7F1 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Q1T7F1 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Q1T7F1 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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