Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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GRIK4Q16099 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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GRIK4Q16099 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GRIK4Q16099 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GRIK4Q16099 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK4Q16099 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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