Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USF2Q15853 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
USF2Q15853 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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