Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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