Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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