Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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FOXE3Q13461 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXE3Q13461 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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