Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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