Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms