Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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PGGT1BP53609 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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