Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TTPAP49638 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TTPAP49638 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TTPAP49638 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TTPAP49638 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TTPAP49638 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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TTPAP49638 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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TTPAP49638 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TTPAP49638 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TTPAP49638 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TTPAP49638 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TTPAP49638 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TTPAP49638 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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