Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LINC00587B1AMM8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LINC00587B1AMM8 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms