Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CTXN3Q4LDR2 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CTXN3Q4LDR2 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CTXN3Q4LDR2 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CTXN3Q4LDR2 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CTXN3Q4LDR2 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CTXN3Q4LDR2 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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