Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms