Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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