Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ATP1A4Q13733 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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