Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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