Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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