Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GPS1Q13098 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms