Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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