Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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