Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VTI1BQ9UEU0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms