Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COPG2Q9UBF2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms