Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA3Q9NZ52 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms