Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TULP4Q9NRJ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TULP4Q9NRJ4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms