Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3GLB2Q9NR46 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3GLB2Q9NR46 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms