Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ASCL3Q9NQ33 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms