Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF17Q9BXT8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms