Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM106CQ9BVX2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms