Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCA3Q99758 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCA3Q99758 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms