Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85AQ96PX6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85AQ96PX6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms