Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227BQ96M60 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227BQ96M60 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms