Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MS4A4AQ96JQ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A4AQ96JQ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms