Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms