Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms