Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms