Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms