Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms